笔记文献管理方案(上)

Auth:oranger       Date:2024/01/14       Cat:学习笔记教程       Word:共4421字

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  1. 管理需求
  2. Zotero
    1. 软件介绍
    2. 下载安装Zotero
    3. 新建文库
    4. 数据同步设置
    5. 手机版Zotero
      1. IOS应用
      2. Android应用
    6. 下载安装Zotero Connector扩展
    7. 安装参考文献样式
    8. 在Word中插入参考文献
    9. 插件安装方法
    10. 插件推荐
      1. Jasminum茉莉花
      2. Zotfile
      3. Zotero Tag
      4. Zotero Reference
      5. Zotero PDF Translate
      6. Obsidian Note for Zotero
      7. Better BibTex for Zotero
  3. 资源下载

我一直在尝试探索一种多端、高效的笔记方式,久闻Obsidian大名,最近偶然看到一篇文章提到OB支持实时预览了,下载体验了一下,就决定从Typora转移到Obsidian,顺带也整理了一下笔记文献的管理思路。

没有任何一个管理思路可以适合所有人,本文仅从我的角度出发探讨一种适合我的笔记文献管理思路,如果能给到你一些思路的话,深感荣幸。

老规矩,先上效果图。

Zotero电脑端页面


Obsidian电脑端页面


Obsidian手机端页面

管理需求

简单来说,我的需求就是能够做到多端同步(电脑+手机+平板),文献列表、笔记、PDF标注都能够做到同步,同时笔记和PDF标注可以联动。

设备:Win电脑+Android手机+ipad

举例说明:

  1. 首先,笔记软件要支持本地管理支持Markdown语法,并且可以实时渲染
  2. 我希望我在电脑上写的笔记可以在手机上可以直接阅读,甚至编辑(包括在手机编辑后电脑上也可以看到);
  3. 我希望我做的笔记可以和文章本身有很好的联动,笔记不要和文章太“脱离”;
  4. 统一管理文献,在Word中方便插入参考文献,可以实现对文献加标签,多级目录。

对比说明:

  1. 【Typora在这方面做得比较好,但收费】
  2. 【很多笔记软件可以做到,但需付费,且很多不支持本地】【同步网盘可以做到电脑编辑手机看,但是反过来效果不好】
  3. 【直接将笔记记在PDF上联动效果最好,但是在电脑对PDF做复杂批注很不方便】【平板上用Notability和Goodnotes很方便,但是在Windows和安卓手机上很难实现同步】
  4. 【文献管理软件不多,扩展性高的更少】

综合以上考虑,最终选择Zotero + Obsidian

但实际上,选用这一套方案有一个缺点,就是在PDF上做的批注并没有储存到PDF文件本身,需要用Zotero内置的阅读器打开才能看到批注。

Zotero

软件介绍

Zotero 是一款开源的文献管理软件,可用于管理、收集、存储、阅读、引用文献。

优点:开源免费、支持多级目录、支持标签管理、支持一键导入引用、插件多可定制性高、界面美观。

缺点:使用内置PDF阅读器进行批注时不能将批注储存到文件本身

官网界面展示

下载安装Zotero

在官网下载Zotero6的安装包(Zotero7还在测试中,许多插件还没有适配)

网站链接:http://www.zotero.org/

安装过程简单,不再赘述。

安装完成后,为了可以直接从网站抓取文章信息以及PDF,需要安装浏览器扩展。

新建文库

点击左上角的书库图标,进入新建群组(书库),会跳转到注册页面,注册后会进入书库设置页面。

新建文库

需要注意文库类型选择私密,除非你想公开你的文献库,操作步骤如下图。

注册Zotero账号

新建完书库,就可以在里面添加文件夹以及文章了。

数据同步设置

注册Zotero账号可以实现参考文献信息同步保存,但是Zotero的存储服务超过300M是收费的,资费情况如下图。

Zotero存储服务收费情况(2024年1月)

但是作为一款开源软件,它还提供了Webdav同步方式,如果你自己有服务器直接用就可以,没有的话,支持Webdav的网盘也有很多,国内比较著名的有坚果云,国外的话推荐InfiniteCLOUD(以前叫TeraCLOUD),这两个提供的免费容量足够每月的正常使用。目前我使用的是TeraCLOUD。

下面开始设置,首先找到编辑-首选项,打开引用页面,如下图。

找到编辑-首选项

打开同步页面,进行相关配置。同步方式选择webav,网址、用户名、密码则在webdav服务提供端获取,不再赘述。

Webdav同步方式

手机版Zotero

IOS应用

由Zotero官方开发,安装后类比上个操作步骤设置好同步即可。

获取方式:IOS商店搜索Zotero。

Android应用

目前官方尚未开发Android端软件,但官方推荐了三款个人开发的软件,可以在Google商店直接下载,如果无法访问,文末提供了这三款软件的下载方法。

zoo for Zoterohttps://play.google.com/store/apps/details?id=com.mickstarify.zooforzotero

ZotDroidhttps://play.google.com/store/apps/details?id=computer.benjamin.zotdr0id

ZotEZ2https://play.google.com/store/apps/details?id=net.ezbio.zotez2

目前我使用的是Zoo for Zotero,如下图。

Zoo for Zotero界面

下载安装Zotero Connector扩展

Zotero Connector扩展的主要功能就是实现浏览器与Zotero的联动。

方法1:在浏览器的扩展商店搜索Zotero Connector(以Edge为例),点击获取即可。

Edge商店Zotero Connector扩展

方法2:在Zotero软件中找到==工具-安装浏览器扩展==,如图所示,会跳转至默认浏览器的扩展安装页面,根据操作安装即可。

Zotero中获取插件方式

安装好后,进入知网等网站的文章页面时,浏览器右上角扩展栏的Zotero Connector扩展会变成文章的logo,点击就可以将文章信息连同PDF导入Zotero

Zotero Connector扩展用法 文献导入Zotero

安装参考文献样式

默认的参考文献格式可能不合要求,需要手动添加常用的参考文献格式。

找到编辑-首选项,打开引用页面,点击获取更多样式,找到你所需的样式安装即可。

获取参考文献格式

我收集了一份工科常用的GB/T 7714-2015参考文献格式的样式文件,可以通过点击加号导入,获取方式已放在文末了。

导入的时候可能会报错,选择OK导入即可。

在Word中插入参考文献

正常安装完Zorero后,会在Word上方选项卡中添加一个Zotero功能区,如图所示。

Word中的Zotero功能区

将光标定位在在你希望插入参考文献的位置,点击功能区的Add/Edit Citation,选择对应的参考文献,就能成功插入参考文献索引号了,但第一次添加时需要再在参考文件章节位置点击Add/Edit Bibliography添加参考文献,效果如图所示。

添加参考文献

插件安装方法

首先获取插件,很多插件都可以在Github上直接获取,由于部分地区访问困难,本文介绍的插件,我已经下载打包好了,获取方法见文末。

点击工具-添加组件,打开插件管理界面。

工具-添加组件

选择,从文件安装,选择下载好的插件即可完成安装,操作如图。图中为我已安装的插件。

安装插件方法

插件推荐

前面提到实现Zotero和Obsidian联动,需要安装的插件为Obsidian Note for ZoteroBetter BibTex for Zotero,除此之外还有一些其他好用必装的插件一并在这里介绍。

Jasminum茉莉花

推荐指数:⭐⭐⭐⭐⭐

主要功能:

  1. 中文期刊附件(PDF/CAJ)的元数据抓取,支持添加PDF/CAJ时自动抓取元数据功能
  2. 集成 Zotero 中文社区转换器的下载与更新功能
  3. 为知网学位论文PDF添加章节书签(依赖于PDFtk)
  4. 更新中文文献引用次数,核心期刊信息
  5. 合并/拆分姓,名,识别文献条目语言,下载知网附件,统一日期格式等

使用此插件需要提前下载并安装好PDFtk,并在插件中设置好对应的目录,注意此处目录设置是bin目录

PDFtk下载链接

其余设置一般保持默认即可,如需设置,设置页面在首选项内。

茉莉花设置界面

项目地址:https://github.com/l0o0/jasminum

Zotfile

推荐指数:⭐⭐⭐⭐⭐

主要功能:用于管理附件(PDF)

  1. 自动重命名、移动附件(Zotero默认管理附件的方式生成的附件文件夹很混乱)(但也不是不能用)
  2. 将PDF添加到zotero条目

遗憾的是,本款插件不再支持Zotero7,如果有计划更新到Zotero7的小伙伴可以尝试另一款软件zotero-file

设置主要设置重命名规则,我个人比较喜欢作者-发表年份-文章名称这种格式。

ZotFile设置

其余设置保持默认即可,安装好插件后,设置会集成到工具栏中。

工具-ZotFile

项目地址:https://github.com/jlegewie/zotfile

Zotero Tag

推荐指数:⭐⭐⭐⭐⭐

主要功能:功能很多,但主要用来设置特色标签(在文章标题前加Emoji),可以实现用快捷键在文章标题前加Emoji(原本是彩色的,在一次系统升级后变成黑白的了,目前还没有找到好的解决办法)

Zotero Tag效果图

我的设置如下,⭐表示重要程度,🔥表示正在阅读,✅表示已阅读完。

Zotero Tag配置

设置好后,给标签加上喜欢的颜色,实现彩色标签功能,方法为:在左下角标签栏右键标签,分配颜色。

分配颜色

项目地址:https://github.com/windingwind/zotero-actions-tags

Zotero Reference

推荐指数:⭐⭐⭐⭐

主要功能:获取参考文献目录,分栏阅读。

实现的效果如下图所示。

Zotero Reference插件效果图

以下为该插件的操作

对刷新按钮的操作说明:

笔记文献管理方案(上) - 第27张图片

操作 触发 说明
点击 解析/获取当前PDF的参考文献 第一次点击会从首选项设置的优先源获取,再次点击刷新会切换到另一个源
长按 如果本地有当前PDF的参考文献缓存,默认是会读取它的,长按则不读取重新解析 所有源都适用
Ctrl + 点击/长按 从当前所在页向前解析参考文献 适用于PDF源,对API源无效,建议解析硕博论文时使用,需要提前将PDF滚动到最后一条参考文献所在页面
双击上图31条参考文献文字 复制当前所有参考文献到剪贴板

对参考文献的操作说明:

笔记文献管理方案(上) - 第28张图片

操作 触发 说明
单击蓝色区域 复制参考文献信息 连同标识符一起复制,如DOI
长按蓝色区域 编辑参考文献信息 建议中文参考文献使用编辑功能以精简条目,提高导入成功率
Ctrl+单击蓝色区域 用系统浏览器打开文献URL 偶尔会查询文献地址消耗一定的时间
单击+ 添加参考文献到正在阅读文献所在的所有文件夹下,并双向关联
Ctrl+单击+ 添加到Zotero主面板选择的文件夹下,并双向关联 如上图的GEE
单击- 取消双向关联 但是不会删除该文献,它仍在我的文库

项目地址:https://github.com/MuiseDestiny/zotero-reference

Zotero PDF Translate

推荐指数:⭐⭐⭐⭐⭐

主要功能:快捷翻译

实现的效果如下图所示,点击翻译即可翻译。

Zotero PDF Translate插件效果图1 Zotero PDF Translate插件效果图2

项目地址:https://github.com/windingwind/zotero-pdf-translate

Obsidian Note for Zotero

推荐指数:⭐⭐⭐⭐⭐

主要功能:与Obsidian联动

安装后可以在文献条目页面一键将标注导入Obsidian(仅支持使用Zotero编辑器做的批注)

Obsidian Note for Zotero插件效果图

项目地址:https://github.com/aidenlx/obsidian-zotero

Better BibTex for Zotero

推荐指数:⭐⭐⭐⭐⭐

主要功能:生成、修改BibTex引用等,在这里主要用于配合Obsidian Note for Zotero与Obsidian联动。

项目地址:https://retorque.re/zotero-better-bibtex

资源下载

点击获取Zotero相关资源下载链接
 
https://qnwt.lanzouq.com/b019zchpa
密码:ecuy

篇幅原因,将Obsidian的相关内容放到了下篇

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